Электрофорез нуклеиновых кислот

Краситель SYBR Gold (несимметричный цианиновый) подходит для окрашивания двуцепочечной и одноцепочечной ДНК, РНК при проведении гель-электрофореза и визуализации геля при помощи стандартного УФ-трансиллюминатора. SYBR Gold более чувствительный, чем SYBR Green II и бромистый этидий, быстро проникает в плотные агарозные гели, не подавляет активность эндонуклеаз, легко удаляется переосаждением НК.

Особенности:

Цвет, оранжевый;

Длина волны возбуждения флуоресценции, 300 нм (УФ), 495 нм (голубой);

Длина волны испускания флуоресценции, 537 нм (желтый);

Температура вспышки, 87 °С;

Условия хранения, -20 °C, в темном месте.

Особенности:

Цвет, оранжевый;

Длина волны возбуждения флуоресценции, 280 нм (УФ), 502 нм (голубой);

Длина волны испускания флуоресценции, 530 нм (зеленый);

Температура кипения, 189 ºС;

Температура плавления, 18,4 ºС;

Температура вспышки, 94 ºС;

Условия хранения, -20 ºС, в темном месте, в оригинальной таре при комнатной температуре;

Индекс риска (R): 20,22,26, 36/37/38, 68 вреден при попадании в дыхательные пути;

Индекс безопасности (S): 9,36,60.

Классический интеркалирующий краситель. Детекция в УФ-диапазоне, этидий бромид флюоресцирует оранжевым цветом. Интенсивность флюоресценции увеличивается примерно в 20 раз при связывании с ДНК. Этидий бромид, сильный мутаген, канцероген, тератоген.

Готовый однократный раствор, в состав которого входят тартразин и ксиленцианол FF (XCFF), применяется для агарозных гелей и готовых гелей E-Gel.

Особенности:

Используется для нанесения образцов ДНК на агарозный гель;

Содержит два красителя (ксиленцианол FF (XCFF) и оранжевый G/ orange G), один движется впереди всех фрагментов ДНК, другой, позади, для лучшей визуализации;

Подходит для фрагментов ДНК от 10 bp до 1 Kb.

Особенности:

Используется при приготовлении маркеров и образцов для нанесения на полиакриламидный или агарозный гель;

Содержит два красителя (ксиленцианол FF (XCFF)) и оранжевый G/ orange G для визуализации фрагментов во время фореза, глицерин для равномерной загрузки на дно лунки и ЭДТА для связывания двухвалентных тонов металлов и ингибирования металл-зависимых протеаз;

Не маскирует ДНК при УФ-экспозиции;

Используется для анализа коротких фрагментов ДНК.

Раствор:

10 мM Tрис-HCl (pH 7,6);

0,15% оранжевый G;

0,03% ксиленцианол FF;

60% глицерин;

60 мM ЭДТА.

Особенности:

Используется для нанесения образцов ДНК на агарозный гель;

Содержит два красителя (ксиленцианол FF (XCFF) и тартразин), один движется впереди всех фрагментов ДНК, другой, позади, для лучшей визуализации;

Подходит для фрагметов ДНК от 100 bp до 10 Kb.

Особенности:

Реагент для приготовления образцов ДНК и маркеров для электрофореза в агарозном или полиакриламидном геле;

Содержит цветные маркерные красители Бромфеноловый синий и ксиленцианол FF для визуального контроля за миграцией фрагментов ДНК в геле;

Также в состав реагента входят глицерин в качестве утяжеляющего агента и ЭДТА в качестве ингибитора нуклеаз;

Не мешает визуализации ДНК в ультрафиолете.

Раствор:

10 мM Tрис-HCl (pH 7,6);

0,03% бромфеноловый синий;

0,03% ксиленцианол FF;

60% глицерин;

60 мM ЭДТА.

Особенности:

Краситель, в состав которого входят бромфеноловый синий, ксиленцианол FF (XCFF), рекомендован для анализа образцов ДНК с высоким содержанием ДНК-связанных белков на агарозном геле после рестрикции, лигирования или дефосфорилирования;

Присутствие 1% SDS устраняет ДНК-белковые связи и предотвращает появление на геле дополнительных полос при отжиге ДНК-молекул с липкими концами;

Высокая концентрация EDTA, 100 mM защищает ДНК от разрушения метал-зависимыми нуклеазами.

Поставляется в 1,4 мл пробирке, не содержит эндонуклеазной, экзонуклеазной, РНКазной активности.

10X раствор:

40 % сахарозы;

0,17 % ксиленцианола FF;

0,17 % бромфенолового синего.