Анализаторы генетические (секвенаторы) 2-го поколения NGS

Сервер Ion Reporter содержит локально развернутый экземпляр программного обеспечения Ion Reporter, сочетающий оптимизированный набор простых инструментов анализа данных с контролем и доступом к мощному компьютерному серверу в вашем собственном здании. Программное обеспечение Ion Reporter поддерживает анализ данных из систем секвенирования следующего поколения (NGS) Ion Torrent, охватывающих все большее число исследовательских приложений, от обнаружения вариантов у человека до разнообразия микробов.

Рабочий процесс ионной информатики обеспечивает высокое качество данных, расставляет приоритеты и аннотирует варианты драйверов, а также завершает отчет, чтобы упростить ваш путь биоинформатики к открытию, позволяя вам сосредоточиться на обнаружении биологического значения ваших данных.

Характеристики:

Операционная система, Ubuntu;

Линия продуктов, программное обеспечение Ion Reporter ™;

Примечания, сервер Ion Reporter:

Последняя версия выпуска, 5.12.3;

Версия поставки сервера, 5.10.5.

Категория программного обеспечения, анализ;

Для использования с (оборудованием), система Ion GeneStudio S5, система Ion PGM ™, система Ion Proton ™, система Ion S5 ™ XL;

Тип программного обеспечения, инструменты информатики.

Система секвенирования следующего поколения Ion S5 ™ обеспечивает простой целевой рабочий процесс секвенирования для вашей лаборатории по доступной цене без ущерба для производительности или надежности. Система Ion S5 использует скорость полупроводникового секвенирования с впечатляющей вычислительной мощностью, чтобы обеспечить получение высококачественных данных секвенирования всего за 2,5 часа и позволить вам перейти от библиотеки ДНК к данным всего за 24 часа с всего 45 минут общего времени работы с системами Ion Chef ™ и Ion S5. Система Ion S5 проста в использовании с реагентами на основе картриджей и предлагает превосходную масштабируемость и гибкость для поддержки широкого спектра приложений высокопроизводительного секвенирования, от микробных геномов и генных панелей до экзомов и транскриптомов, с использованием наших чипов 5-й серии.

Технические характеристики:

Принцип работы, полупроводниковое секвенирование, встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;

Не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;

Точность анализа, 99,9 %;

Полученные результаты обсчитываются серверной станцией;

Длина рида, 200 или 400 п.н.;

Длительность запуска, 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);

Количество прочтений, млн.:

Ion 520, 3-5;

Ion 530, 15-18;

Ion 540, 60-80.

Гибкая система чипов разной производительности, п.н.:

Ion 520, 0,6-1 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 1,2-2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);

Ion 530, 3-3,5 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 6-7,2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);

Ion 540, 10-15 млрд. (при длине рида 200 п.н.).

Длительность анализа:

Ion 520, 5 ч (при длине рида 200 п.н.), 8 ч (при длине рида 400 п.н.);

Ion 530, 8 ч (при длине рида 200 п.н.), 17,5 ч (при длине рида 400 п.н.);

Ion 540, 16,5 ч (при длине рида 200 п.н.).

Габариты, ШхГхВ, 542×806×509 мм;

Вес нетто/брутто, 63,5/90,7 кг.

Особенности:

Менее 15 минут ручного труда для запуска секвенатора, менее 45 минут ручного труда для процедуры таргетного секвенирования от ДНК до результатов;

Запуск секвенатора длится от 2,5 до 4 часов, от ДНК до результатов всего 24 часа;

Небольшое количество стартового материала: 10 нг HK или РНК невысокого качества достаточно для получения полного списка мутаций или профиля экспрессии генов;

Масштабируемость: один секвенатор для разнообразных экспериментальных задач, несколько форматов чипов для соответствия изменяющимся требованиям научных исследований.

Аксессуары и опции:

Наборы реагентов;

Чипы для секвенирования: Ion 520, Ion 530 и Ion 540.

Система секвенирования следующего поколения Ion S5 ™ XL обеспечивает простой целевой рабочий процесс секвенирования для вашей лаборатории с надежной производительностью и ведущей в отрасли скоростью. Система Ion S5 XL использует скорость полупроводникового секвенирования с впечатляющей вычислительной мощностью, найденной как на борту, так и на входящем в комплект торрент-сервере, чтобы получить высококачественные данные секвенирования всего за 2,5 часа и позволить вам перейти от библиотеки ДНК к данным всего за 24 часа всего за 45 минут общего практического времени на системе Ion Chef ™ и системе Ion S5 XL. Система Ion S5 XL проста в использовании с реагентами на основе картриджей и обеспечивает превосходную масштабируемость и гибкость для поддержки широкого спектра высокопроизводительных приложений секвенирования, от микробных геномов и генных панелей до экзомов и транскриптомов, используя наш чипсет 5-й серии.

Технические характеристики:

Принцип работы, полупроводниковое секвенирование, встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;

Не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;

Точность анализа, 99,9 %;

Полученные результаты обсчитываются серверной станцией;

Длина рида, 200 или 400 п.н.;

Длительность запуска, 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);

Количество прочтений, млн.:

Ion 520, 3-5;

Ion 530, 15-18;

Ion 540, 60-80.

Гибкая система чипов разной производительности, п.н.:

Ion 520 - 0,6-1 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 1,2-2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);

Ion 530 - 3-3,5 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 6-7,2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);

Ion 540 - 10-15 млрд. (при длине рида 200 п.н.).

Длительность анализа:

Ion 520, 1 ч (при длине рида 200 п.н.), 2 ч (при длине рида 400 п.н.);

Ion 530, 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);

Ion 540, 5 ч (при длине рида 200 п.н.).

Габариты, ШхГхВ, 542×806×509 мм;

Вес нетто/брутто, 63,5/90,7 кг.

Аксессуары и опции:

Наборы реагентов;

Чипы для секвенирования Ion 520, Ion 530 и Ion 540.

Система Ion GeneStudio S5 - это система секвенирования нового поколения (NGS) на основе полупроводников, которая обеспечивает простые целевые рабочие процессы секвенирования. Он оптимизирован для обеспечения доступности для лабораторий, ориентированных на меньшие панели и более низкие требования к производительности секвенирования.

Система Ion GeneStudio S5 Prime - это система секвенирования нового поколения (NGS) на основе полупроводников, которая обеспечивает простые целевые рабочие процессы секвенирования. Для основных лабораторий и лабораторий обслуживания, которым требуется максимальная пропускная способность и быстрое время выполнения работ от настольной системы NGS, система Ion GeneStudio S5 Prime обеспечивает беспрецедентную широту и глубину, от больших панелей или экзомов до клинических онкологических исследований, ориентированных на приложения с низкой частотой аллелей.

Система Ion Chef - это следующее поколение продуктов для упрощения рабочего процесса для систем Ion GeneStudio S5. Система Ion Chef обеспечивает автоматическую подготовку библиотеки, подготовку шаблонов и загрузку микросхем для пользователей с любым уровнем опыта. Менее чем за 15 минут предварительной подготовки и с использованием предварительно упакованных наборов реагентов для подготовки библиотек, система Ion Chef обеспечивает удобный рабочий процесс, в результате чего объединенные библиотеки в уравновешенный пул готовы для создания шаблонов. Автоматизированный рабочий процесс поддерживает проекты Ion AmpliSeq с одним и двумя пулами.

Технические характеристики:

Упрощает и автоматизирует процесс подготовки матрицы и загрузки чипов;

Помогает снизить вариабельность получаемых результатов для пользователей любого уровня;

Помогает экономить время и силы, на ручную подготовку запуска уходит всего 15 минут, за один запуск система загружает один или два полупроводниковых чипа Ion для секвенирования;

Совместимость с секвенаторами, Ion S5, Ion S5 XL, Ion Proton и Ion PGM;

Совместимость с чипами, все полупроводниковые чипы Ion;

Совместимость с библиотеками, подходит для подготовки матриц для широкого спектра ДНК- и РНК-библиотек, в том числе библиотек Ion AmpliSeq;

Габариты, ШхГхВ, 711×548×706 мм;

Вес, 80 кг.

Настольный высокопроизводительный секвенатор полупроводникового секвенирования.

Технические характеристики:

Ключевая особенность данного прибора, это встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;

Не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;

Точность анализа, 99,9 %;

Полученные результаты обсчитываются серверной станцией;

Имеет чипы разной производительности, п.н.:

Ion Proton I, до 10×109;

Ion Proton II, до 100×109;

Ion Proton III, до 250×109.

Производительность до 200 последовательностей за 2 часа;

Длина чтения, п.н.- до 200;

Производительность за запуск, п.н., 1×109;

Общее время запуска, менее 2 часов.

Аксессуары и опции:

Серверная станция Torrent Server;

Набор реагентов;

Чипы для секвенирования Ion 314, Ion 316 и Ion 318;

Станция автоматической пробоподготовки Ion OneTouch 2 (позволяет подготовить образцы для секвенирования за 5-7 часов).

Система Ion PGM Dx обеспечивает скорость и простоту платформы NGS в сочетании с ключевыми преимуществами рабочего процесса, разработанными для регулируемых лабораторных сред и приложений диагностики in vitro (IVD) в дополнение к разработке тестов для приложений клинических исследований.

Технические характеристики:

Ключевая особенность данного прибора, это встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;

Не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;

Точность анализа, 99,9 %;

Полученные результаты обсчитываются серверной станцией;

Гибкая система чипов разной производительности, п.н.:

Ion 314, до 40×106;

Ion 316, до 400×106;

Ion 318, до 2×109.

Производительность до 200 последовательностей за 2 часа;

Длина чтения, до 400 п.н.;

Производительность за запуск, 1×109 п.н.;

Общее время запуска, менее 2 часов;

Габариты, ШхГхВ, 610×510×530 мм;

Вес нетто/ брутто, 30/39 кг.

Аксессуары и опции:

Серверная станция Torrent Server;

Набор реагентов;

Чипы для секвенирования Ion 314, Ion 316 и Ion 318;

Станция автоматической пробоподготовки Ion OneTouch 2 (позволяет подготовить образцы для секвенирования за 5-7 часов);

Станция автоматической пробоподготовки Ion Chef Avalanche (конец 2013, ожидается, что позволит сократить время пробоподготовки до 2 часов).

Система Ion OneTouch 2 выполняет усиление и обогащение шаблонов в рамках ручного рабочего процесса для систем Ion PGM, Ion Proton, Ion S5 и Ion S5 XL. Он обеспечивает масштабируемую подготовку шаблона для всех полупроводниковых чипов Ion. Благодаря своей небольшой площади, система легко помещается на любом рабочем столе.

Система Ion OneTouch 2 объединяет несколько этапов ручной подготовки шаблонов в единую систему. Это позволяет выполнять параллельную обработку нескольких образцов в день за счет модульной конструкции. Он является гибким и поддерживает масштабируемую подготовку шаблонов для всех микросхем Ion Semiconductor Sequence: до 400 баз в чипах Ion 520/530, до 200 баз в чипе Ion 540, до 400 баз в системе Ion PGM и до 200 оснований по Ионно-Протонной Системе. Потребность в газе устраняется применением перистальтического насоса.

Интегрированный секвенсор Ion Torrent Genexus является частью системы Ion Torrent Genexus, первого готового решения для секвенирования следующего поколения (NGS), которое автоматизирует рабочий процесс от образца до отчета и может предоставить результаты в течение одного дня.